يستخدم الميكونازول لعلاج الالتهابات الجلدية مثل قدم الرياضي وحكة اللعب والقوباء الحلقية والتهابات الجلد الفطرية الأخرى (داء المبيضات).
يستخدم هذا الدواء أيضًا لعلاج حالة الجلد المعروفة باسم النخالية (سعفة المبرقشة)، وهي عدوى فطرية تسبب تفتيح أو تغميق جلد العنق أو الصدر أو الذراعين أو الساقين.
